Áhrif vetniseldsneytis á öndunarfæri manna hafa verið áhyggjuefni. Þar sem vetniseldsneyti, hreinn orkugjafi, nýtur vaxandi notkunar í ýmsum greinum, eru spurningar um öryggi þess viðvarandi, sérstaklega ef gasleka er að ræða.
Vetniseldsneyti sjálft hefur ekki eiturverkanir eða hættur. Þar sem vetni er eldfimt gas er það venjulega geymt við háan þrýsting eða lágt hitastig, sem leiðir til áhættu svipaðar öðrum eldfimum lofttegundum.
Hins vegar, samanborið við sumt algengt eldsneyti, er vetni almennt talið hafa minni áhættu í för með sér. Þetta er vegna þess að vetni er afar létt gas sem, jafnvel þótt það leki út í loftið, rís hratt upp og dreifist og dregur úr skaða þess á mönnum.
Engu að síður, ef umtalsvert magn af vetni lekur inn í lokað rými, getur það flutt súrefni í loftinu, sem leiðir til köfnunarhættu. Þrátt fyrir þetta er vetnisgas sjálft ekki eitrað, sem þýðir að innöndun vetnis veldur ekki eitrun en getur valdið súrefnisskorti.
Að lokum má segja að öryggi vetniseldsneytis sé háð geymslu þess og meðhöndlun. Með því að beita viðeigandi ráðstöfunum og eftirliti er hægt að draga úr hugsanlegri áhættu og gera vetni kleift að gegna stærra hlutverki í hreina orkugeiranum.
