PEM og AEM vísa til tveggja mismunandi tegunda raflausna sem notaðar eru í eldsneytisfrumum. PEM stendur fyrir Proton Exchange Membrane en AEM stendur fyrir Anion Exchange Membrane.
Helsti munurinn á PEM og AEM er jónin sem þau flytja. PEM flytja róteindir en AEM flytja anjónir. Í PEM efnarafali er vetnisgasi leitt yfir platínuhvata sem skiptir vetnissameindunum í róteindir og rafeindir. PEM leyfir aðeins róteindum að fara í gegnum, en rafeindirnar neyðast til að flæða í gegnum ytri hringrás og framleiða rafmagn. Á hinn bóginn, í AEM efnarafali, er súrefnisgasi leitt yfir hvata, sem myndar hýdroxíðjónir. AEM leyfir aðeins hýdroxíðjónum að fara í gegnum, en jákvætt hlaðnar jónir neyðast til að flæða í gegnum ytri hringrás og framleiða rafmagn.
Annar munur á PEM og AEM er rekstrarskilyrði þeirra. PEM þarf tiltölulega lágt hitastig (um 80-100 gráður) og rakt umhverfi til að virka rétt. AEM, aftur á móti, geta starfað við hærra hitastig (allt að 120-150 gráður) og þurfa ekki rakt umhverfi.
Hvað varðar afköst hafa PEMs meiri aflþéttleika og skilvirkni en AEMs, en þau eru líka dýrari í framleiðslu. AEM eru aftur á móti ódýrari í framleiðslu en hafa minni afköst.
Á heildina litið fer valið á milli PEM og AEM eftir sérstökum kröfum eldsneytisfrumunotkunarinnar. PEM eru almennt notuð í bílaumsóknum en AEM eru oft notuð í kyrrstæðum forritum, svo sem varaaflkerfi fyrir byggingar.
